حساسیت نسبت به ارزش های اسلامی و دفاع از آن، مقابله علمی با اندیشه های انحرافی التقاطی و خرافی، اهتمام به حوزه و دانشگاه با حضور در میان حوزیان و دانشگاهیان و تغذیه فکری و عقیدتی آنان، توجه به بعد اجتماعی اسلام و دفاع از نظام و رهبری، تغذیه فکری نسل جوان و فرهیختگان دانشگاهی، رویکرد جامع به اسلام و پیوند زدن آموزه های اسلامی با نیازهای انسان معاصر و شبهه زدایی از آن، عنایت ویژه به نسل جوان و صیانت آنان در برابر تهاجمات فرهنگی، مبارزه با غرب زدگی و مرعوب شدن در برابر غرب و نقد تفکر اومانیستی و سکولار، مخاطب شناسی و بیان معارف اسلامی متناسب و با زبان قابل فهم مخاطبان، منطق مستحکم و قوی و بیان روان ورسا و شناخت دقیق آسیب های فکری و درد دین داشتن و عشق به نسل جوانِ تشنه معارف اسلام، از جمله خصائص مرحوم آیت الله مصباح بودند که موجب شدند تا رهبر انقلاب او را متصف به صفت «مطهری زمان» کنند.
مرحوم آیت الله مصباح یزدی البته وجوه سیاسی بسیار قوی نیز داشت و اقدامات روشنگرایانه او نسبت به معرفی درونمایه فکری جریان لیبرالی در دوران قدرت گفتمان اصلاحات در ایران موجب شد تا او همواره مورد حمله جریان تجدیدنظرطلب
باشد.